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Thomas Stather

Telefon:+49 6221 486-628Fax:+49 6221 486-585

E-Mail: Thomas.Stather@​mpimf-heidelberg.mpg.de

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Zentrale Einrichtung Lichtmikroskopie

Die Zentrale Einrichtung Lichtmikroskopie des MPI für Medizinische Forschung soll Wissenschaflern des Institutes und von außerhalb die Nutzung von komplexen, aktuellen Methoden der Lichtmikroskopie und der lichtmikroskopischen Datenanalyse bieten, Unterstützung und Training für Probenvorbereitung, Datenaufnahme und Datenanalyse bieten sowie die Kommunikation und den Austausch von experimentellen Erfahrungen fördern.

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Datenbanken und datenbankbetriebene Anwendungen

Datenbanken und datenbankbetriebene Anwendungen

Oracle Database 10g

Die Oracle Datenbank läuft in der Version 10g (g = Grid Control), Release 2, und dient als Backend für das Infopark CMS Fiona Content Management System.

MySQL 5 Database

Die Hauptanwendungen sind

  • die Redaktionsmodule zur Verwaltung von Veranstaltungs-, Mitarbeiter-, Publikations- und Bibliotheksdaten
  • die Wiki-Systeme
  • LimeSurvey
  • das Mantis Trouble-Ticket-System
  • das "unattended" System Management Tool

Eine Master-Slave-Replikation vom MySQL Server auf die MySQL Server in der Demilitarisierten Zone (DMZ) ist eingerichtet. Darüber hinaus steht er als Multi Purpose System für die verschiedensten Einsätze jedem Wissenschaftler am Institut als Datenbanksubsystem zur Verfügung.

PostgreSQL

Ausschliesslich für die OMERO Anwendung (hauptsächlich genutzt von der Zentralen Einrichtung Lichtmikroskopie, Dr. Günter Giese) wurde ein PostgreSQL Server aufgesetzt. OMERO ist eine moderne Client / Server Anwendung zum Visualisieren, verwalten und Kommentieren von Mikroskopiebildern und Metadaten. Es ist eine Zusammenstellung mehrerer Komponenten, die Bilddatenvisualisierung, Kommentierung, Import, Archivierung, Protokollaufzeichnung und Benutzerverwaltung zur Verfügung stellen. OMERO besteht aus J2EE Java Enterprise Application Server Komponenten sowie aus Java Client Anwendungen.

 
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